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新DNA显微(wei)镜“从内到外”绘制生命3D图,分子(zi),相(xiang)互作用,位(wei)置

记者 张梦然

美国芝加哥大学的迷信家(jia)开辟出一种名为体积DNA显微(wei)镜的革命性成像技术。该(gai)技术可“从内到外”绘制生命3D图，迷信家(jia)经过标记和追踪分子(zi)间的相(xiang)互作用，构建出复(fu)杂的遗(yi)传(chuan)物质3D图，进(jin)而提供亘古未有(you)的生物体内视图。相(xiang)关研究结(jie)果揭(jie)橥在新一期《自然·生物技术》杂志上。

传(chuan)统(tong)的基因测序方法虽能揭(jie)示样(yang)本中丰(feng)富的遗(yi)传(chuan)信息，但(dan)没(mei)法表现特定(ding)基因序列在样(yang)本中的具体位(wei)置，或(huo)其与周围基因和分子(zi)的关系。为填补这(zhe)一缺点，新研发的技术能够在捕捉遗(yi)传(chuan)物质身份的同时记录其位(wei)置信息。该(gai)方法经过给单个DNA或(huo)RNA分子(zi)增加短的DNA序列标签，即唯(wei)一分子(zi)标识符UMI，然后跟踪这(zhe)些标签之间的相(xiang)互作用来完成。这(zhe)种相(xiang)互作用有(you)助于创建反映(ying)基因空间排列的分子(zi)网络，从而生成一个三维图像。

在利用体积DNA显微(wei)镜时，UMI会(hui)附着于细胞内的DNA和RNA分子(zi)上，并开始复(fu)制。这(zhe)个历程会(hui)产生唯(wei)一变乱标识符UEI。每个UEI都是唯(wei)一无(wu)二的，它们赞助肯(ken)定(ding)每个基因分子(zi)的具体位(wei)置。相(xiang)邻的UMI因相(xiang)互作用频繁，产生的UEI也较多，这(zhe)为较量争论模型提供了重修原始位(wei)置所需的信息，进(jin)而创建基因表达的空间图。

与依附光线或(huo)镜头的传(chuan)统(tong)显微(wei)镜没(mei)有(you)同，体积DNA显微(wei)镜依靠较量争论分子(zi)间的相(xiang)互作用来创建图像。这(zhe)种方法被比喻为利用手机数据(ju)肯(ken)定(ding)城市中人们的位(wei)置，就像知道手机号码(ma)能够赞助定(ding)位(wei)个人一样(yang)，分析分子(zi)间的互动也能够推断它们在体内的位(wei)置。

这(zhe)项技术没(mei)有(you)依附先(xian)前知识，因此(ci)适用于探索未知背景下的基因表达情况。如(ru)在肿(zhong)瘤研究中，其可用于绘制肿(zhong)瘤微(wei)情况及免疫零碎交互作用的地(di)图，这(zhe)对(dui)付发展更精确的癌症免疫治疗或(huo)定(ding)制个性化疫苗具有(you)紧张意义(yi)。